动物源替加环素耐药大肠杆菌的分离鉴定及分子特征分析

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第一章 动物源大肠杆菌对替加环素耐药机制的研究进展

1.1.1 大肠杆菌培养特性

1.1.2 大肠杆菌分类

1.1.3 大肠杆菌血清型

1.1.4 大肠杆菌耐药现状

1.2.1 替加环素作用机制

1.2.2 替加环素抗菌谱

1.3 替加环素耐药机制研究进展

1.3.1 RND多药外排泵

1.3.2 Tet蛋白突变

1.3.3 Tet(X)基因

1.3.5 其他耐药机制

1.4 替加环素耐药现状

1.5 研究目的与意义

第二章 动物源替加环素耐药大肠杆菌分离鉴定与耐药性分析

2.1 实验材料

2.1.1 样品及菌株

2.1.2 耗材试剂

2.1.3 仪器设备

2.1.4 培养基和主要试剂配制

2.2.1 样本采集

2.2.2 细菌的分离与保存

2.2.3 革兰氏染色镜检与生化试验

2.2.4 大肠杆菌特异性基因phoA PCR鉴定

2.2.5 16S rRNA菌种鉴定

2.2.6 耐药基因PCR初筛

2.2.7 分离株最小抑菌浓度MIC测定

2.3 试验结果

2.3.1 各地区替加环素耐药大肠杆菌分离结果

2.3.2 大肠杆菌分离株培养特性

2.3.3 大肠杆菌的特异性基因PCR鉴定

2.3.4 16S rRNA菌种鉴定

2.3.5 大肠杆菌分离株替加环素耐药基因初筛

2.3.6 大肠杆菌分离株MIC结果

2.4 讨论

2.5 小结

第三章 大肠杆菌分离株的全基因组测序分析

3.1.1 实验菌株

3.1.2 耗材试剂

3.1.3 仪器设备

3.2.1 菌株复苏

3.2.2 菌株DNA的提取

3.2.3 全基因组测序

3.2.4 生物信息学分析

3.3 试验结果

3.3.1 MLST分型和系统发育分析

3.3.2 耐药基因谱

3.3.3 血清型与毒力基因谱

3.3.4 质粒类型分析

3.3.5 耐药基因基因组比较分析

3.4 讨论

3.5 小结

第四章 分离株脉冲场凝胶电泳与耐药菌接合试验

4.1.1 实验菌株

4.1.2 耗材试剂

4.1.3 仪器设备

4.1.4 实验动物

4.1.5 主要试剂配制

4.2.1 菌株复苏

4.2.2 脉冲场凝胶电泳S1-PFGE

4.2.3 接合前验证

4.2.4 分离株体外接合试验

4.2.5 分离株小鼠体内接合试验

4.2.6 接合子最小抑菌浓度MIC测定

4.3.1 S1-PFGE结果

4.3.2 接合转移试验结果

4.3.4 接合子MIC结果

4.3.5 接合子PCR与S1-PFEG检测

4.4 讨论

4.5 小结

第五章 结论

参考文献

致谢

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