星博学术 | 国内首部“综合性”携带者筛查关键问题专家共识要点浅析
在2024年国际罕见病日到来前夕,由中国遗传学会遗传诊断分会和上海市遗传学会临床遗传与遗传咨询专委会组织制定的《综合性携带者筛查关键问题专家共识(2024版)》在《国际遗传学杂志》正式发表。在本专家共识中首次提出“综合性携带者筛查”的概念,为遗传病预防、家庭生育和个人健康管理提供了一定的指导建议。
要点浅析
1、“综合性”携带者筛查的概念:用以强调携带者筛查还应包括显性遗传病,且涵盖从胎儿、围产期致死性疾病到成年临床可干预性疾病。
“综合性携带者筛查”(Comprehensive carrier screening)是本专家共识首次提出的概念。综合性携带者筛查是一项针对没有明显遗传病表型,但可能携带遗传病基因致病变异的个体进行的筛查性检测。与常规携带者筛查的区别是,综合性携带者筛查的疾病不仅包括隐性遗传病,也包括具有临床干预意义的成年显性遗传病。(另须注意,该概念仅包含单基因病,染色体病、基因组病和其他基因组结构变异的携带者筛查不属于“综合性携带者筛查”概念范畴)
2、“综合性携带者筛查”的适用人群:主要参考北美标准。
由于国内携带者筛查起步相对较晚、筛查量相对较少,故本专家共识关于“综合性携带者筛查”的临床适应人群描述基本参考自美国医学遗传学和基因组学会(ACMG,American College of Medical Genetics and Genomics)的现有推荐,即“综合性携带者筛查”基因和疾病的纳入标准讨论主要考虑以下原则:基因和疾病的临床有效性(即某一基因与特定疾病的相关性高低。本专家共识推荐使用ClinGen网站发布的标准与评估方法,根据https://www.clinicalgenome.org/,有效性分类在“Definitive”或“Strong”及以上级别的等位基因被认为是有临床意义的筛查目标)、疾病严重性(本专家共识推荐参考Lazarin等人于2014年在《PLoS One》上发表的分类办法,将“中度”及以上级别的等位基因作为有临床意义的筛查目标)、基因携带率和疾病患病率(本专家共识推荐参考ACMG的标准,建议筛查的纳入范围为备孕及孕期携带率≥1/200的常染色体隐性遗传病和患病率≥1/40000的X连锁遗传病。此外本专家共识也指出ACMG的标准主要针对北美人群因此国内群体在使用时存在一定局限性,故建议在考虑基因和疾病的临床有效性、疾病的严重性、成本和获益等其他原则的情况下,还应充分参考区域人群的基因携带率和疾病患病率,适当调整筛查范围,并根据具体场景确定报告范围)、成本和获益、显性遗传病的临床可干预性。
3、意义未明变异(VUS)的报告处理原则:根据潜在致病性分类报道。
意义未明变异(VUS,Variant of Uncertain Significance),是指基于现有循证尚无法判断是否会导致特定疾病的等位基因突变。因为VUS的定义分类依据的是现有证据,故其分类可能会随时间的推移与循证的更新而发生变化。本专家共识推荐在报告VUS时通过ClinGen自带的贝叶斯分类框架定量评估VUS并评估VUS重新分类的潜在性。例如:
(1)夫妻一方检测出常染色体隐性遗传病致病基因的致病性或可能致病性变异,而另一方检测出同一基因的VUS;
(2)夫妻双方检测出常染色体隐性遗传病同一致病基因的VUS;
(3)受检者检测出常染色体显性或X连锁遗传病致病基因的VUS。
若上述VUS按ClinGen贝叶斯分类框架评分为4-5分,或具有重新分类为致病性/可能致病性的潜在性,检测机构在报告时应予以重点关注并与其他VUS加以区分。
《综合性携带者筛查关键问题专家共识(2024版)》全文:
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